Kemudian pada tahun 1990 berdasarkan keputusan Menteri Agama Republik Indonesia No. 64 /1990 berubah status menjadi MAN Salatiga. Berdiri di wilayah Salatiga dengan luas tanah 5.113 m2 dan luas bangunan 2.882 m2 Hak milik No. 49, di Jalan K.H. Wahid Hasyim No. 12 Telp. (0298) 323031. Seiring dengan pembangunan yang terus dilaksanakan oleh Madrasah maka luas bangunan hingga saat ini ditulis seluas 4.847 m2. Di samping itu MAN Salatiga juga mengembangkan Program Tahfizh Al Qur’an MAN Salatiga

Sesuai dengan penerapan kurikulum baru yaitu Kurikulum Merdeka Belajar, MAN Salatiga sebagai lembaga pendidikan formal berkomitmen menyelenggarakan pendidikan serta latihan sebagai pemenuhan kebutuhan pasar kerja dengan membentuk sumber manusia yang berakhlak mulia, unggul, berbudaya, sekaligus mandiri dan berwawasan ke depan. Melalui kurikulum Madrasah Aliyah Negeri Salatiga ini diharapkan pelaksanaan program-program pendidikan di Madrasah Aliyah Negeri Salatiga sesuai dengan karakteristik potensi, dan kebutuhan peserta didik agar dapat memberi kesempatan peserta didik untuk :

• Belajar untuk beriman dan bertaqwa kepada Tuhan Yang Maha Esa;

• Belajar untuk memahami dan menghayati;

• Belajar untuk mampu melaksanakan dan berbuat secara efektif;

• Belajar untuk hidup bersama dan berguna untuk orang lain, dan

• Belajar untuk membangun dan menemukan jati diri melalui proses belajar yang aktif, kreatif, efektif, menyenangkan dan Islami.